Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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