Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msrb2Q78J03 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms