Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Zbtb40Q6PCS8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Zbtb40Q6PCS8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Zbtb40Q6PCS8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms