Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slf2Q6P9P0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms