Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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