Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
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Krt40Q6IFX3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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