Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms