Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Msl2Q69ZF8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms