Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms