Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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PtprdQ64487 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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PtprdQ64487 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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PtprdQ64487 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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PtprdQ64487 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PtprdQ64487 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PtprdQ64487 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PtprdQ64487 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PtprdQ64487 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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PtprdQ64487 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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