Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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