Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms