Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms