Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms