Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms