Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms