Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms