Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms