Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms