Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms