Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc3lQ4KL14 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms