Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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