Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Fam220aQ3ZN08 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Fam220aQ3ZN08 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Fam220aQ3ZN08 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Fam220aQ3ZN08 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Fam220aQ3ZN08 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Fam220aQ3ZN08 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Fam220aQ3ZN08 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Fam220aQ3ZN08 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Fam220aQ3ZN08 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Fam220aQ3ZN08 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Fam220aQ3ZN08 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Fam220aQ3ZN08 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Fam220aQ3ZN08 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Fam220aQ3ZN08 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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