Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms