Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms