Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Gm28047Q3US59 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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