Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TceancQ3US16 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms