Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms