Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms