Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms