Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms