Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U595 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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