Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hace1Q3U0D9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms