Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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