Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shcbp1lQ3TTP0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms