Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gtf3c3Q3TMP1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gtf3c3Q3TMP1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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