Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Trappc13Q3TIR1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Trappc13Q3TIR1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Trappc13Q3TIR1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Trappc13Q3TIR1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Trappc13Q3TIR1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms