Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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RubcnlQ3TD16 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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