Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms