Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

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Length 1,197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Zbtb38Q3LR78 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zbtb38Q3LR78 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zbtb38Q3LR78 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zbtb38Q3LR78 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zbtb38Q3LR78 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zbtb38Q3LR78 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zbtb38Q3LR78 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zbtb38Q3LR78 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms