Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdgfl1Q2VPR5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms