Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms