Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms