Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms