Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms