Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms