Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms