Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms