Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms