Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrriq1Q0P5X1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms